中國基因組深度注釋取得重要進(jìn)展 美揭示腦癌細(xì)胞長壽秘密

• 2018年9月12日 FanTianQing來源：新浪網(wǎng) 767 46
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  2018-2024年中國醫(yī)療垃圾處理行業(yè)發(fā)展前景及投資風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測分析報(bào)告

  隨著醫(yī)療垃圾處理行業(yè)競爭的不斷加劇，大型企業(yè)間并購整合與資本運(yùn)作日趨頻繁，國內(nèi)外優(yōu)秀的醫(yī)療垃圾處理企業(yè)愈來愈重視對行業(yè)市場的分析研究，特別是對當(dāng)前市場環(huán)境和客戶需求趨勢變化的深入研...

對復(fù)雜的基因組進(jìn)行深入研究，確定哪些基因翻譯蛋白質(zhì)，哪些基因不翻譯蛋白質(zhì)，以及對這些基因的分布和結(jié)構(gòu)進(jìn)行精準(zhǔn)描述等，是國際學(xué)界探尋生命奧秘的前沿課題之一。

中國基因組深度注釋取得重要進(jìn)展。

對復(fù)雜的基因組進(jìn)行深入研究，確定哪些基因翻譯蛋白質(zhì)，哪些基因不翻譯蛋白質(zhì)，以及對這些基因的分布和結(jié)構(gòu)進(jìn)行精準(zhǔn)描述等，是國際學(xué)界探尋生命奧秘的前沿課題之一。我國科研人員在該課題研究方面取得重要進(jìn)展，全新的研究成果已在線發(fā)布于國際期刊《分子植物》。

記者近日從中國科學(xué)院水生生物研究所了解到，該所葛峰研究員學(xué)科組利用蛋白基因組學(xué)的研究策略和方法，成功對單細(xì)胞光合真核生物三角褐指藻的基因組進(jìn)行了深度注釋，完成了三角褐指藻的蛋白質(zhì)組精細(xì)圖譜，并建立了完整的真核生物基因組深度注釋實(shí)驗(yàn)技術(shù)和分析流程。

據(jù)該研究成果第一作者、高級實(shí)驗(yàn)師楊明坤介紹，基因組是一種生物的所有遺傳信息，以往對基因組進(jìn)行深度注釋多采用生物信息學(xué)的方法，而與之相比，蛋白基因組學(xué)的方法更直接，也更可靠。

楊明坤說，蛋白質(zhì)是基因與生命活動的最終執(zhí)行者，運(yùn)用蛋白基因組學(xué)的方法對基因組進(jìn)行深度注釋，不僅能夠發(fā)現(xiàn)新的蛋白質(zhì)，還能夠發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)翻譯后修飾現(xiàn)象。此次團(tuán)隊(duì)的研究為三角褐指藻基因組的6628個(gè)基因提供了蛋白質(zhì)水平上的支持，并且發(fā)現(xiàn)1895個(gè)基因不翻譯蛋白質(zhì)。特別是，他們新發(fā)現(xiàn)了許多可以翻譯蛋白質(zhì)的基因，其中相當(dāng)一部分此前被學(xué)界認(rèn)為是長鏈非編碼的基因。

更為重要的是，該研究建立的實(shí)驗(yàn)技術(shù)和分析流程，可適用于各種已經(jīng)完成基因組測序的真核生物，為真核生物基因組深度注釋提供了重要工具。

楊明坤說，蛋白基因組學(xué)從蛋白質(zhì)層面檢測蛋白表達(dá)變化、調(diào)控模式以及與疾病相關(guān)的基因突變。因此，該研究成果的取得，有望進(jìn)一步推動蛋白基因組學(xué)在生命和健康領(lǐng)域特別是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)方面的應(yīng)用。

（圖片源于網(wǎng)絡(luò)）

美揭示腦癌細(xì)胞長壽秘密

美國加州大學(xué)舊金山分校研究人員發(fā)現(xiàn)，GABP蛋白的一種特定成分GABP-β1L，是與端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶（TERT）啟動子突變相關(guān)的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞不受控制地分裂、繁殖的關(guān)鍵。他們10日在《腫瘤細(xì)胞》雜志上發(fā)表論文稱，新發(fā)現(xiàn)提供了一個(gè)很有前途的用藥靶點(diǎn)，對未來膠質(zhì)母細(xì)胞瘤及其他多種與TERT啟動子突變相關(guān)癌癥的治療具有重要意義。

比健康細(xì)胞長壽，是腫瘤細(xì)胞的重要特征之一，它們的分裂次數(shù)不會像健康細(xì)胞一樣受到嚴(yán)格限制，因此可以持續(xù)地分裂，不斷擴(kuò)散?？茖W(xué)家認(rèn)為，腫瘤細(xì)胞的這種能力可能與TERT啟動子突變有關(guān)。TERT啟動子突變是所有人類癌癥中最常見的三種突變之一，也是致命腦癌膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中最常見的突變。最近有研究稱，超過50種癌癥是由TERT啟動子突變引起的。還有研究表明，這些突變會使GABP的轉(zhuǎn)錄因子與TERT啟動子綁定并激活它，但是在健康細(xì)胞中，GABP和TERT通常彼此無關(guān)。

此次，加州大學(xué)舊金山分校研究人員發(fā)現(xiàn)，具有TERT啟動子突變的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者，其體內(nèi)腫瘤細(xì)胞要依賴GABP蛋白才能生存。這種蛋白對大多數(shù)細(xì)胞的運(yùn)作都至關(guān)重要，但其中的一個(gè)特定成分——GABP-β1L，在正常細(xì)胞中似乎沒有存在的必要。當(dāng)研究人員通過CRISPR基因編輯技術(shù)等手段，從實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞中消除GABP-β1L時(shí)，腫瘤細(xì)胞的生長速度明顯減慢。隨后的小鼠實(shí)驗(yàn)顯示，未經(jīng)編輯的、源自人類患者的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞在植入小鼠體內(nèi)后生長迅速，會很快導(dǎo)致小鼠死亡；而經(jīng)基因編輯后缺乏GABP-β1L的腫瘤細(xì)胞在小鼠體內(nèi)則生長緩慢，其致死性也較低。

研究人員指出，GABP-β1L是一種有前途的新藥靶點(diǎn)，對于治療膠質(zhì)母細(xì)胞瘤及其他多種與TERT啟動子突變相關(guān)的癌癥具有重要意義。他們將尋找與實(shí)驗(yàn)中使用的基因編輯技術(shù)具有相似效果的小分子藥物，推動相關(guān)癌癥的治療。

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